Účinky muchovníku se mohou značně lišit v závislosti na individuální citlivosti, emočním a fyzickém stavu v době podání, dávkování, době a místě sběru hub a správnosti jejich sušení.
První účinky se dostavují asi hodinu po požití houby v podobě lehkého chvění v končetinách. Dále může být touha spát, pocit únavy.
Muchomůrka působí jako silný fyzický stimulant – objevuje se mimořádná lehkost a síla, jakákoliv zátěž se provádí mnohem snadněji, bez únavy. Psychoaktivní účinek houby se obvykle projevuje následovně: pokud jde člověk spát, pak se ponoří do jakési ospalosti s vizemi a zvýšenou citlivostí na zvuky. Pokud je vzhůru, mohou se objevit zrakové a sluchové halucinace. Obecně je to vše samozřejmě přísně individuální. Působení muchovníku trvá až 7 hodin, po skončení působení není pozorováno nic jako kocovina.
Z nežádoucích účinků zaznamenáváme nevolnost, která se může objevit v první hodině a půl. Pokud si nevezmete houby nalačno, pak je nevolnost častější. Může se také objevit bolest v břiše.