Plísňové infekce často vznikají z prosté nerovnováhy mikroorganismů přirozeně se vyskytujících v těle.

Ve skutečnosti je kolonizována mnoha různými houbami a bakteriemi, většinou neškodnými a dokonce nezbytnými pro správné fungování těla.

Může se však stát, že některé z těchto hub se množí a stanou se patogenními, nebo že „vnější“ houba, přenášená například zvířetem, způsobí infekci. Celkem 200-400 druhů hub může způsobit onemocnění u lidí⁵.

Houby přítomné v životním prostředí však mohou také kontaminovat lidi, například:

• očkováním, například během poranění (vedoucí ke sporotrichóze nebo chromomykóze atd.);
• vdechováním plísní (histoplazmóza, apergilóza atd.);
• kontaktem s infikovanou osobou (kandidóza, kožní onemocnění atd.);
• prostřednictvím kontaktu s nakaženým zvířetem.